Seguindo uma mecânica similar antecessora para o Nintendo DS, Big Brain Academy: Wii Academy é uma versão para o console da Nintendo que exige do jogador o uso de sua massa encefálica para resolver diversos mini-games rápidos, porém, diferente da série Brain Age, Big Brain Academy remete mais a Wariowario: Smooth Moves já que os desafios colocam a prova mais a habilidade técnica do jogador do que sua capacidade de memória e raciocínio.
Dentre outros exemplos, Big Brain Academy: Wii Degree exige que o jogador reconheça determinados objetos em um rol de opções conforme uma palavra é pronunciada na tela. Em outros casos, o jogador deve arranjar fotografias em determinada ordem, conforme uma lógica natural. É claro que o Wii-Mote é largamente usado, através da mecânica: aponte e clique. O alto-falante presente no controle também é usado para narrar através de sons a cena, além de exigir que o usuário o use de forma a simular um telefone em alguns joguinhos.
Graficamente, Big Brain Academy: Wii Degree é simples e direto, com elementos basicamente 2d que não exigem muito processamento do aparelho. O resultado final são muitos elementos geométricos com bordas suaves, além de fotografias e figurinhas simples usadas nos mini-games. Por fim, o uso efetivo dos Miis (avatares feitos ao gosto do jogador) completa o jogo, permitindo-o interagir com seu alter-ego virtual de maneira raramente vista até então no console.
