Apesar do nome, Rune Factory 3: A Fantasy Harvest Moon é a quarta edição da linha Rune Factory da tradicional franquia de simuladores de fazenda/RPG Harvest Moon. Desenvolvido pela Neverland Co. o título segue a mesma fórmula dos outros títulos da série, combinando ação, elementos de RPG e gestão de uma fazenda.
O jogo simula a vida em uma fazenda, permitindo que você crie animais, plante e colha flores e vegetais, além de construir sua própria família. No entanto, a linha Rune Factory também conta com vários elementos de ação, como a exploração de masmorras e caça de monstros.
Desta vez você assume o papel de Micah, um garoto desmemoriado que aparece em uma pequena cidade. Shara, a heroína da história, encontra o rapaz e o coloca para cuidar de uma fazenda.
A inteligência artificial com agendamento dinâmico das colheitas e os ajustes nos comandos de batalha e nas interações com os outros personagens são as grandes novidades desta edição.